Un 13 de mayo de 1981, su atacante, Mehmet Ali Agca disparó 4 veces en contra del Sumo Pontífice.
Ese fatídico 13 de mayo en la Plaza de San Pedro, uno de los 30 mil asistentes a la ceremonia, atentó con un arma de fuego en contra del Papa Juan Pablo II, provocando una perforación intestinal. Los disparos se alojaron principalmente en su estómago, sin embargo, el resto de los proyectiles alcanzaron su brazo derecho y uno rozó su mano izquierda.
El joven Turco Mehmet Ali Agca, de 23 años fue quien casi cometió el magnicidio por motivaciones que hasta el día de hoy no se han esclarecido.
Las motivaciones de Ali, orbitan en teorías de carácter político y relativas a órdenes dadas por el servicio secreto de la URSS, la KGB. Otra de las hipótesis que se han barajado fue la de la relación del atentado con mafias búlgaras y de Alemania Oriental.
Por último, la condena para el joven turco fue de cadena perpetua, la que posteriormente fue revocada por el Presidente Azeglio Ciampi, quien lo indultó luego de que el turco recibiera el perdón del mismo Papa Juan Pablo II.
